Тункинский котловинный стационар расположен в 110 км западнее Иркутска, в пос. Аршан, на северном склоне Тункинской межгорной котловины. Полигон стационара включает в себя бассейн р. Кынгарги (часть бассейна р. Иркут) и прилегающие участки междуречий. Стационар является базовым для реализации комплексных экспедиционно-стационарных исследований современной структуры и функционирования геосистем Тункинской котловины и ее горного обрамления (хр. Хамар-Дабан, хр. Тункинские гольцы), сопряженных с изучением их динамики и эволюции.